И в чем здесь проблема?
Проблема состоит в том, что все установленные ОС должны совместно
использовать диски, а в начале работы системы BIOS обращается только к
первому диску, на котором в самом начале должна быть, так называемая,
"таблица разделов". Эта таблица разделов находится в Главной Загрузочной
Записи MBR (Master Boot Record) вместе с начальным загрузчиком (boot
loader).
Некорректное использование MBR любой ОС может привести к проблемам.
При попытке установить любую систему, ответ "да", на вопрос типа
"Автоматически разбить диск на разделы?", скорее всего, приведет к
трудностям... Это чаще всего происходит с Windows, особенно со специальными
установщиками Windows, включаемыми в поставку новых компьютеров (без
настоящего дистрибутивного диска с Windows). И, к сожалению, стали уже не
редкостью проблемы с "умными" (а на самом деле не очень умными)
установщиками Linux в новых дистрибутивах.